Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms