Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUS3Q9BZE2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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