Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAPERQ9BY12 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms