Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf88Q9BSF0 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf88Q9BSF0 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf88Q9BSF0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf88Q9BSF0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf88Q9BSF0 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf88Q9BSF0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf88Q9BSF0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf88Q9BSF0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf88Q9BSF0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms