Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LPIN3Q9BQK8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms