Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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