Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPNS2Q96L46 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
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