Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms