Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EME1Q96AY2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EME1Q96AY2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EME1Q96AY2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EME1Q96AY2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EME1Q96AY2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EME1Q96AY2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EME1Q96AY2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EME1Q96AY2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EME1Q96AY2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EME1Q96AY2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EME1Q96AY2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EME1Q96AY2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EME1Q96AY2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EME1Q96AY2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EME1Q96AY2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EME1Q96AY2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EME1Q96AY2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EME1Q96AY2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EME1Q96AY2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EME1Q96AY2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EME1Q96AY2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EME1Q96AY2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms