Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms