Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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C11orf40Q8WZ69 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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C11orf40Q8WZ69 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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C11orf40Q8WZ69 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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C11orf40Q8WZ69 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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C11orf40Q8WZ69 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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C11orf40Q8WZ69 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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C11orf40Q8WZ69 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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C11orf40Q8WZ69 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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C11orf40Q8WZ69 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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C11orf40Q8WZ69 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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C11orf40Q8WZ69 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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C11orf40Q8WZ69 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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