Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPAP2Q8IXW5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms