Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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USP43Q70EL4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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USP43Q70EL4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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USP43Q70EL4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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USP43Q70EL4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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USP43Q70EL4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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USP43Q70EL4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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USP43Q70EL4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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