Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms