Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms