Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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