Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms