Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 RGL4-209ENST00000612432 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms