Protein–RNA interactions for Protein: Q52M75

LINC01554, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01554, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01554Q52M75 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC01554Q52M75 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms