Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms