Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SP6Q3SY56 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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SP6Q3SY56 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SP6Q3SY56 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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