Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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COL24A1Q17RW2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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