Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFKFB3Q16875 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFKFB3Q16875 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFKFB3Q16875 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFKFB3Q16875 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFKFB3Q16875 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFKFB3Q16875 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFKFB3Q16875 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFKFB3Q16875 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFKFB3Q16875 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFKFB3Q16875 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFKFB3Q16875 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFKFB3Q16875 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFKFB3Q16875 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFKFB3Q16875 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFKFB3Q16875 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFKFB3Q16875 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFKFB3Q16875 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFKFB3Q16875 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFKFB3Q16875 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PFKFB3Q16875 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFKFB3Q16875 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms