Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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