Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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