Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NCOA1Q15788 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms