Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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