Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
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