Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NBR1Q14596 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBR1Q14596 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms