Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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KLF9Q13886 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLF9Q13886 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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