Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
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