Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSTA3Q13630 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms