Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms