Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms