Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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