Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NME3Q13232 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NME3Q13232 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NME3Q13232 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NME3Q13232 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NME3Q13232 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NME3Q13232 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NME3Q13232 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME3Q13232 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME3Q13232 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME3Q13232 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME3Q13232 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME3Q13232 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME3Q13232 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME3Q13232 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME3Q13232 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME3Q13232 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME3Q13232 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME3Q13232 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME3Q13232 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME3Q13232 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NME3Q13232 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME3Q13232 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME3Q13232 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME3Q13232 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME3Q13232 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME3Q13232 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME3Q13232 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME3Q13232 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NME3Q13232 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME3Q13232 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME3Q13232 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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