Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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