Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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