Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMAN2Q12907 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMAN2Q12907 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMAN2Q12907 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMAN2Q12907 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMAN2Q12907 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LMAN2Q12907 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMAN2Q12907 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMAN2Q12907 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMAN2Q12907 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMAN2Q12907 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMAN2Q12907 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMAN2Q12907 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMAN2Q12907 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMAN2Q12907 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMAN2Q12907 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMAN2Q12907 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMAN2Q12907 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
LMAN2Q12907 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMAN2Q12907 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMAN2Q12907 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMAN2Q12907 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
LMAN2Q12907 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMAN2Q12907 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMAN2Q12907 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMAN2Q12907 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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