Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms