Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EP300Q09472 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EP300Q09472 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EP300Q09472 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EP300Q09472 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EP300Q09472 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EP300Q09472 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EP300Q09472 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EP300Q09472 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EP300Q09472 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EP300Q09472 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms