Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC1Q08554 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC1Q08554 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms