Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms