Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SIM1P81133 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIM1P81133 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIM1P81133 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIM1P81133 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIM1P81133 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIM1P81133 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIM1P81133 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIM1P81133 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIM1P81133 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIM1P81133 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIM1P81133 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIM1P81133 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIM1P81133 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SIM1P81133 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIM1P81133 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIM1P81133 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIM1P81133 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIM1P81133 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIM1P81133 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIM1P81133 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIM1P81133 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIM1P81133 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIM1P81133 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SIM1P81133 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms