Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HBBP68871 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HBBP68871 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HBBP68871 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HBBP68871 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HBBP68871 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HBBP68871 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HBBP68871 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HBBP68871 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HBBP68871 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HBBP68871 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HBBP68871 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HBBP68871 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HBBP68871 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HBBP68871 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HBBP68871 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HBBP68871 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HBBP68871 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HBBP68871 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HBBP68871 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms