Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms