Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ1P61923 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms