Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms