Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA1P59665 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA1P59665 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA1P59665 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA1P59665 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA1P59665 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA1P59665 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
DEFA1P59665 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
DEFA1P59665 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms