Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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